More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2331 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  63.5 
 
 
138 aa  174  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  50.83 
 
 
155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  39.52 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  38.71 
 
 
130 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 
142 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  42.97 
 
 
132 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  40.56 
 
 
147 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 
158 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 
158 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.4 
 
 
132 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  42.52 
 
 
135 aa  99.4  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  37.1 
 
 
128 aa  98.2  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 
138 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  46.83 
 
 
133 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  41.27 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  37.25 
 
 
176 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  40.15 
 
 
176 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  35.53 
 
 
177 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  42.06 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  36.6 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  40.15 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  35.57 
 
 
171 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  42.19 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  45.08 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  38.69 
 
 
158 aa  94.4  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  43.51 
 
 
134 aa  94.4  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  43.51 
 
 
134 aa  94.4  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  43.51 
 
 
134 aa  94.4  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  43.51 
 
 
134 aa  94.4  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  40.48 
 
 
159 aa  94  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 
134 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
138 aa  94  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
141 aa  94  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  40.48 
 
 
173 aa  93.6  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  37.31 
 
 
144 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.4 
 
 
142 aa  93.6  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  39.84 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  40.62 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  43.2 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.35 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  34.68 
 
 
128 aa  93.6  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
134 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  36.96 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  38.28 
 
 
144 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.2 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  40.15 
 
 
163 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  42.4 
 
 
132 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
172 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  40.77 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  42.4 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  39.42 
 
 
157 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  37.67 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  44 
 
 
132 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
134 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
134 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
173 aa  90.5  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  40.48 
 
 
157 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
134 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  35.77 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  39.13 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  45.04 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  36.29 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  42.62 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  46.46 
 
 
159 aa  88.2  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  35.77 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.4 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  35.77 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  35.77 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  35.77 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  35 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  39.24 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  35.77 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  39.84 
 
 
133 aa  88.2  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  35.82 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  41.6 
 
 
155 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  35.34 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  38.76 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  41.09 
 
 
186 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 
135 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>