More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3724 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  100 
 
 
141 aa  290  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  88.65 
 
 
141 aa  260  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  88.65 
 
 
141 aa  260  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  88.65 
 
 
141 aa  260  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  87.94 
 
 
141 aa  258  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  87.94 
 
 
141 aa  258  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  85.11 
 
 
141 aa  253  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  85.11 
 
 
141 aa  253  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  85.11 
 
 
141 aa  253  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  85.11 
 
 
141 aa  253  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  85.11 
 
 
141 aa  253  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  85.11 
 
 
141 aa  253  7e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  85.11 
 
 
141 aa  253  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  85.11 
 
 
141 aa  253  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  85.11 
 
 
141 aa  253  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  72.59 
 
 
143 aa  215  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  72.59 
 
 
144 aa  211  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  72.59 
 
 
141 aa  210  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  72.59 
 
 
141 aa  210  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  48.91 
 
 
159 aa  141  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  47.45 
 
 
144 aa  137  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  50.38 
 
 
171 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  50.38 
 
 
171 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  50.38 
 
 
176 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  50.38 
 
 
176 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  50.38 
 
 
156 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  48.18 
 
 
173 aa  135  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  48.87 
 
 
158 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  48.09 
 
 
157 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  48.48 
 
 
157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  48.85 
 
 
157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  48.09 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  47.45 
 
 
159 aa  134  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 
163 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 
153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  44.78 
 
 
171 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 
132 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  45.04 
 
 
139 aa  122  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  42.52 
 
 
140 aa  120  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 
157 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  42.97 
 
 
132 aa  100  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
132 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
132 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
146 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
174 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  40.62 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  43.08 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  39.53 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 
151 aa  94.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 
151 aa  94.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  39.53 
 
 
148 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  41.41 
 
 
146 aa  94  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
146 aa  94  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 
144 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.23 
 
 
162 aa  93.6  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  38.19 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  39.23 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  39.06 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
137 aa  92.8  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  39.55 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  39.85 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
144 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.85 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  38.93 
 
 
186 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  38.28 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
147 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
157 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 
159 aa  90.1  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 
142 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 
143 aa  89.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
147 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
150 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 
142 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  40.94 
 
 
143 aa  89  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
136 aa  88.6  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
138 aa  88.6  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
161 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  38.35 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  39.84 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.84 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.38 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>