More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3979 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  354  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  93.51 
 
 		 157 aa  295  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  66.17 
 
 		 139 aa  187  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  67.42 
 
 		 141 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  68.18 
 
 		 140 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  68.18 
 
 		 140 aa  184  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  65.15 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  65.15 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  63.85 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  61.7 
 
 		 146 aa  171  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  63.91 
 
 		 141 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 161 aa  168  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 140 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  57.86 
 
 		 140 aa  158  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  55.3 
 
 		 140 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 162 aa  148  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  57.48 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 137 aa  144  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  54.89 
 
 		 142 aa  140  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  55.47 
 
 		 138 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 137 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 137 aa  134  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 137 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 137 aa  132  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 140 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  51.94 
 
 		 133 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  47.33 
 
 		 133 aa  124  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 137 aa  122  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 139 aa  122  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  45.8 
 
 		 133 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 139 aa  119  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 140 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 140 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  57.14 
 
 		 132 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 131 aa  108  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 138 aa  107  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 141 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  35.66 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 152 aa  101  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  43.51 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  43.51 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  46.43 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 150 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  46.43 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  34.97 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  42.75 
 
 		 141 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  42.75 
 
 		 141 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 129 aa  97.8  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  39.37 
 
 		 159 aa  97.4  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  38.28 
 
 		 143 aa  97.4  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  41.98 
 
 		 141 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 146 aa  97.1  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  41.98 
 
 		 141 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 144 aa  97.1  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  41.98 
 
 		 141 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 142 aa  97.1  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.84 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  40.16 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  39.55 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  40.62 
 
 		 152 aa  95.9  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 175 aa  95.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  38.28 
 
 		 144 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 146 aa  94.4  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  37.69 
 
 		 152 aa  94.4  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  38.4 
 
 		 155 aa  94.4  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 134 aa  93.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 146 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 126 aa  93.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  37.86 
 
 		 146 aa  94  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 141 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 147 aa  92.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  41.35 
 
 		 135 aa  91.7  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 144 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 144 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>