More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4070 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 132 aa  260  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  60.95 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  60.95 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  57.8 
 
 		 140 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  57.01 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  57.8 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  65.71 
 
 		 142 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  57.14 
 
 		 141 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  59.43 
 
 		 142 aa  130  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  58.88 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  57.41 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  57.94 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 137 aa  125  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  59.05 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  56.07 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  56.07 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 145 aa  120  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 137 aa  120  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  50.83 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 136 aa  117  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  51.38 
 
 		 133 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  50.85 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 140 aa  113  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 139 aa  110  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  48.15 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 162 aa  106  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  43.85 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  48.11 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  41.67 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  42.11 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  40.44 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  40.44 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  43.31 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  42.54 
 
 		 186 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 136 aa  100  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.31 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  43.44 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 147 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 147 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 143 aa  93.6  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  45.19 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  45.19 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  45.19 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  40.54 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  45.19 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  45.19 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  45.19 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  45.19 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  45.19 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  45.19 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  45.37 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  38.52 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  42.37 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  42.37 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 129 aa  90.5  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  41.44 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.76 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 134 aa  88.6  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 139 aa  88.6  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>