More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1642 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 143 aa  292  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 143 aa  292  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  85.31 
 
 		 144 aa  249  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  84.4 
 
 		 144 aa  243  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  70.42 
 
 		 145 aa  204  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  72.31 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  67.42 
 
 		 186 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  61.87 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  61.87 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  59.4 
 
 		 136 aa  167  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  54.41 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  54.41 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 147 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 147 aa  146  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  55.04 
 
 		 156 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  51.91 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  54.26 
 
 		 156 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  48.63 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  50 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  49.61 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 134 aa  139  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  50 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 144 aa  137  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  51.94 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 135 aa  137  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  48.84 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  52.71 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 143 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  46.56 
 
 		 133 aa  130  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  42.52 
 
 		 138 aa  127  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  46.09 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  46.88 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  44.19 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  44.19 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  44.19 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  44.53 
 
 		 143 aa  120  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 162 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 145 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0693  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  40.46 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  40.44 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2421  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.732276  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2051  transcriptional regulator, MerR family  43.51 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  37.98 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>