More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1129 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
131 aa  252  9e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  63.78 
 
 
137 aa  157  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  61.72 
 
 
139 aa  153  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  59.06 
 
 
133 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  59.06 
 
 
141 aa  147  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  52.34 
 
 
138 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  52.76 
 
 
133 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
136 aa  134  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  51.18 
 
 
133 aa  130  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  50.39 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  54.33 
 
 
140 aa  124  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  48.82 
 
 
142 aa  124  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  48.82 
 
 
142 aa  124  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  51.18 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  48.03 
 
 
140 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  50.39 
 
 
161 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  57.41 
 
 
132 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  47.24 
 
 
140 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  47.24 
 
 
142 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  50.39 
 
 
141 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 
146 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  45.6 
 
 
141 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  47.66 
 
 
141 aa  116  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
140 aa  115  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
140 aa  115  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  47.24 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  46.56 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  51.18 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  47.66 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  47.33 
 
 
144 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  46.09 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  46.83 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  47.29 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  44.88 
 
 
129 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
174 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
139 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  44.53 
 
 
132 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  49.21 
 
 
151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  44.88 
 
 
132 aa  106  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  43.09 
 
 
140 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 
142 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  46.09 
 
 
157 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
144 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 
132 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  45.67 
 
 
140 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  40.31 
 
 
143 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  43.85 
 
 
132 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
171 aa  103  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
176 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
176 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 
171 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
155 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
136 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 
134 aa  103  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
136 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  40.77 
 
 
160 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  40.77 
 
 
160 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  44.96 
 
 
151 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  41.46 
 
 
148 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.88 
 
 
134 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
136 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
146 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.94 
 
 
147 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
141 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  44.96 
 
 
151 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
154 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
143 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
149 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  44.19 
 
 
159 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.53 
 
 
144 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  40.31 
 
 
144 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
147 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.88 
 
 
134 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 
152 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.88 
 
 
134 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
154 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  44.53 
 
 
137 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 
147 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 
152 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
154 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
137 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 
155 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
150 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
134 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
137 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  41.46 
 
 
148 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
146 aa  100  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  44.88 
 
 
129 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  40.6 
 
 
159 aa  100  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
134 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  43.18 
 
 
156 aa  100  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  38.93 
 
 
170 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.015587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>