More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2017 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  283  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  283  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  80.71 
 
 		 141 aa  239  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  66.19 
 
 		 139 aa  192  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  63.57 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  62.14 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 157 aa  184  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  65.15 
 
 		 174 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  59.29 
 
 		 141 aa  176  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  61.19 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  59.85 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 161 aa  170  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  61.94 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 140 aa  164  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  53.57 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 134 aa  147  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  52.63 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 162 aa  140  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 137 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 136 aa  127  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 137 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  56.07 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  49.61 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 131 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  43.51 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  42.75 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  46.96 
 
 		 152 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  46.09 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  46.09 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  46.09 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  46.09 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  40.48 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  42.97 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  47.62 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  42.52 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  45.31 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  45.31 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  45.31 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  39.68 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  44.53 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  44.53 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  40.6 
 
 		 159 aa  97.1  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  43.75 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 172 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  39.26 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  38.93 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 140 aa  94.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  38.93 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 147 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  43.52 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  37.01 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>