More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0993 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  79.41 
 
 		 137 aa  223  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  56.62 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  56.62 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  58.73 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 140 aa  151  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  57.14 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  56.69 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  56.35 
 
 		 133 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  53.68 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  55.73 
 
 		 140 aa  146  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  57.48 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  52.21 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  56.69 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  56.69 
 
 		 139 aa  145  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 138 aa  141  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  52.27 
 
 		 140 aa  141  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 142 aa  140  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  50.76 
 
 		 139 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 137 aa  140  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 145 aa  137  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  49.26 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 174 aa  133  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  49.26 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  52.76 
 
 		 156 aa  129  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  50 
 
 		 148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 152 aa  127  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  51.97 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  48.41 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  46.88 
 
 		 144 aa  123  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  43.8 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  54.95 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 137 aa  120  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  46.51 
 
 		 186 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  48.03 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 134 aa  119  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  47.24 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  45.31 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  46.46 
 
 		 144 aa  116  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 175 aa  116  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  48.84 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  47.66 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  47.66 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  46.46 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  46.09 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  47.24 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  44.96 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 143 aa  110  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 132 aa  110  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  44.53 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  44.53 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  44.53 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  44.53 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>