More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0747 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
141 aa  278  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  75.18 
 
 
144 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  51.97 
 
 
147 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  50.38 
 
 
137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  50.81 
 
 
172 aa  124  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
146 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  47.62 
 
 
133 aa  120  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  47.1 
 
 
142 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  46.83 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  44.85 
 
 
140 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  48.03 
 
 
151 aa  114  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  44.53 
 
 
133 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  46.83 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  45.67 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
139 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  42.19 
 
 
132 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 
142 aa  110  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 
142 aa  110  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  42.06 
 
 
135 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
130 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  43.85 
 
 
142 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  42.22 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  46.83 
 
 
141 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
161 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
146 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  41.48 
 
 
144 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  44.09 
 
 
135 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  44.09 
 
 
135 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  41.54 
 
 
132 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 
147 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
152 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
139 aa  102  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 
132 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  44.03 
 
 
132 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
136 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
162 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.89 
 
 
128 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
138 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  42.54 
 
 
135 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  39.2 
 
 
130 aa  100  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.68 
 
 
135 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
134 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  38.4 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  38.1 
 
 
133 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  42.52 
 
 
158 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  42.52 
 
 
158 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
159 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
136 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
136 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  42.86 
 
 
150 aa  97.8  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  40 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  38.35 
 
 
147 aa  97.1  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
166 aa  97.4  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
162 aa  97.1  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
144 aa  97.1  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 
155 aa  97.1  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  37.3 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
150 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  41.04 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  39.55 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  36.64 
 
 
169 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  35.94 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  35.71 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
136 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  41.73 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  41.6 
 
 
146 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
133 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  41.6 
 
 
146 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  41.73 
 
 
186 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
182 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 
142 aa  93.6  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
149 aa  94  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>