More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0137 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  291  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  53.68 
 
 		 139 aa  156  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 146 aa  156  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  54.41 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  50.71 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 141 aa  149  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 174 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  49.63 
 
 		 140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  55.12 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  55.91 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  48.15 
 
 		 141 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 137 aa  140  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 139 aa  140  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  49.29 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 137 aa  137  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 138 aa  131  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 138 aa  126  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  53.77 
 
 		 132 aa  120  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 140 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 141 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 175 aa  99.4  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  39.23 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 172 aa  98.2  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 126 aa  96.7  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  36.96 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  36.15 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  36.96 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  37.32 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 136 aa  94.7  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  37.3 
 
 		 129 aa  94.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 186 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.59 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  38.94 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  37.04 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  34.62 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  35.71 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  34.11 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  34.35 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  34.35 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  35.04 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  32.58 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0693  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  32.58 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  35.38 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 155 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  34.09 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>