More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0920 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  290  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  80.71 
 
 		 140 aa  239  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  80.71 
 
 		 140 aa  239  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  68.35 
 
 		 139 aa  203  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  61.43 
 
 		 140 aa  193  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  61.7 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  60 
 
 		 140 aa  189  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  66.15 
 
 		 157 aa  180  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  63.85 
 
 		 174 aa  176  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  61.31 
 
 		 161 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  62.69 
 
 		 141 aa  173  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  57.86 
 
 		 140 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 146 aa  167  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  52.55 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  55.47 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 134 aa  152  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 145 aa  149  8.999999999999999e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  51.49 
 
 		 142 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 137 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  57.01 
 
 		 132 aa  133  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 139 aa  124  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 138 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 137 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  48.44 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  44.27 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  45.24 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  43.51 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 152 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  43.51 
 
 		 186 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  39.26 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  44.35 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  41.98 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  44.35 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  42.97 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  39.68 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  42.97 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  42.97 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.58 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.58 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.58 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.58 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  44.35 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.4 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 155 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  38.89 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  42.19 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  42.19 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  42.19 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  41.41 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  41.41 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 172 aa  95.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>