More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4523 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  300  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  47.33 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 152 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.54 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.54 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.54 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 140 aa  105  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.54 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.54 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  44.03 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  36.72 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  35.94 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  39.69 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  39.69 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  39.55 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  40.77 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 171 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  39.42 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 172 aa  97.1  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  38.85 
 
 		 167 aa  97.1  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  39.23 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  39.23 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  40.46 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.46 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  35.88 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  40.94 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  38.17 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  39.55 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  40.46 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  38.93 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  34.51 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  40.77 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  40.46 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 132 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  37.69 
 
 		 170 aa  92.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  38.64 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  39.69 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.64 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 186 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 174 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1950  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 149 aa  90.5  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.329857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 132 aa  90.5  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 138 aa  90.5  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 162 aa  90.5  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 136 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 130 aa  90.5  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 166 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>