More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4426 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 134 aa  273  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  67.88 
 
 		 137 aa  190  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 161 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  52.55 
 
 		 141 aa  140  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 137 aa  119  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  43.8 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 145 aa  114  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 140 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  43.38 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  42.42 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  48.33 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  43.31 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  38.93 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  38.93 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  37.69 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  37.69 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  37.69 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  40.16 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  40.16 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  37.69 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  37.69 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  37.69 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  37.69 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  37.69 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  37.69 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  37.69 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  37.69 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  34.35 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  37.69 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  36.15 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  37.69 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  37.69 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  36.15 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 172 aa  83.6  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1950  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.329857 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  36.43 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  35.38 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  35.71 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  35.38 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  35.43 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  34.56 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>