More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4116 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  93.18 
 
 		 133 aa  248  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  61.72 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  63.28 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 139 aa  166  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  59.23 
 
 		 136 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  53.97 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  48.85 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 134 aa  123  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  47.69 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  45.8 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  45 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  45.93 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  45.04 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  46.46 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  46.03 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  44.29 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  44.88 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  44.53 
 
 		 157 aa  114  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 142 aa  114  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 146 aa  113  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  43.61 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  46.09 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 132 aa  110  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  46.4 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  42.22 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  44.09 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.04 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  43.85 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  44.2 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 142 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  45.52 
 
 		 132 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  43.85 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  45.11 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  45.31 
 
 		 186 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  42.75 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  40.16 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>