More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2302 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
132 aa  266  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
132 aa  266  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  93.94 
 
 
132 aa  249  9.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  58.14 
 
 
186 aa  156  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  58.02 
 
 
132 aa  156  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  57.48 
 
 
147 aa  153  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  57.48 
 
 
147 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  55.81 
 
 
162 aa  153  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  53.44 
 
 
151 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  53.44 
 
 
151 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  55.64 
 
 
157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  56.25 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  55.73 
 
 
156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  56.69 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  54.96 
 
 
156 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  55.91 
 
 
147 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  53.49 
 
 
159 aa  148  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  55.12 
 
 
150 aa  147  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  53.54 
 
 
149 aa  147  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  52.71 
 
 
134 aa  146  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  56.69 
 
 
148 aa  146  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  55.91 
 
 
148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  52.71 
 
 
145 aa  144  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  53.91 
 
 
135 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  52.71 
 
 
143 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
144 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
146 aa  140  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  51.94 
 
 
143 aa  139  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  51.94 
 
 
144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  50.38 
 
 
144 aa  137  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  51.54 
 
 
152 aa  137  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  49.61 
 
 
144 aa  135  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  48.84 
 
 
143 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  48.84 
 
 
143 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  49.24 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  49.24 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  49.22 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  49.22 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  49.22 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  49.22 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  49.22 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  49.22 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  49.22 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  48.06 
 
 
136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  49.22 
 
 
143 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
143 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  49.22 
 
 
143 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  49.22 
 
 
143 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  47.29 
 
 
154 aa  131  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
143 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
143 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
143 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  45.31 
 
 
143 aa  128  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
146 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  43.51 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  43.51 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
135 aa  124  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  43.51 
 
 
162 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  42.52 
 
 
138 aa  124  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
135 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
135 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
135 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
135 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
135 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
135 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
135 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 
146 aa  123  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
135 aa  123  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  44.96 
 
 
133 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
135 aa  123  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  41.54 
 
 
170 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  45.04 
 
 
145 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
135 aa  121  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  42.97 
 
 
144 aa  120  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  43.41 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
129 aa  117  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 
137 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 
133 aa  107  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2421  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  44.27 
 
 
158 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.732276  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2051  transcriptional regulator, MerR family  44.27 
 
 
158 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
140 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2916  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
154 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0693  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
153 aa  103  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 
133 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 
133 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 
139 aa  100  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
142 aa  100  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
142 aa  100  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  38.52 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1816  MerR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0245036  normal  0.855302 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  41.79 
 
 
141 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  41.22 
 
 
135 aa  98.6  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  41.79 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>