More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2562 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2562  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  263  8.999999999999999e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  55.2 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  44.7 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 172 aa  105  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 152 aa  105  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  45.86 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  42.31 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  38.76 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  41.54 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  42.97 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  39.39 
 
 		 144 aa  95.9  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  44.36 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  39.55 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  39.69 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  40.77 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  38.76 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  38.93 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  43.61 
 
 		 140 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  42.75 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 		 135 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  36.22 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  36.72 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  42.75 
 
 		 155 aa  93.6  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  36.22 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  39.85 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  41.98 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  38.1 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  40 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.94 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  39.23 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  37.3 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  34.13 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.76 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  38.93 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  38.81 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  36.92 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.92 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.92 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.92 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.92 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 142 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  38.28 
 
 		 142 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  39.69 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 135 aa  90.1  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 159 aa  90.1  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.51 
 
 		 132 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.92 
 
 		 154 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  89.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.69 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  41.41 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>