More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3492 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  100 
 
 		 135 aa  277  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  81.75 
 
 		 130 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  73.81 
 
 		 128 aa  202  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  77.52 
 
 		 131 aa  194  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  70.08 
 
 		 150 aa  176  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  60 
 
 		 134 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  59.13 
 
 		 116 aa  146  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  52.85 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  49.6 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  45.74 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  49.6 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  48.8 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  48.8 
 
 		 151 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 136 aa  126  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  48.8 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  48.8 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  48.8 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  48.8 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  48.8 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  48.8 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  48.8 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  48 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  48 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  46.83 
 
 		 135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  48 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  47.2 
 
 		 144 aa  124  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  44.35 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  43.2 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  42.4 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  44.8 
 
 		 136 aa  116  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 141 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  40.32 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 173 aa  103  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 172 aa  103  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  40.8 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  40.8 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  39.2 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  38.4 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  37.98 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  37.6 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  41.6 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 139 aa  92.8  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  36.72 
 
 		 133 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 133 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  37.21 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 133 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3242  transcriptional regulator, MerR family  33.86 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  33.58 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  34.88 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 138 aa  87  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  38.4 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  34.88 
 
 		 163 aa  86.7  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 140 aa  86.7  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 176 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 176 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  34.88 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  34.11 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36.8 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>