More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1095 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1095  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 172 aa  101  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  36.43 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 146 aa  99.4  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  35.66 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.86 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.86 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.86 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.86 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.86 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  39.02 
 
 		 133 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  34.81 
 
 		 153 aa  94  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  35.77 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 166 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  38.21 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  33.08 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 182 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  35.88 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3242  transcriptional regulator, MerR family  37.01 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  37.27 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  37.27 
 
 		 158 aa  90.5  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 154 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 163 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  37.01 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  89.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  34.11 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  32.58 
 
 		 169 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 		 173 aa  87.8  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 130 aa  87.4  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  35.45 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.01 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 132 aa  87.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 137 aa  86.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  36.22 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.5 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0032  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.4 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 176 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  33.83 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 176 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  34.96 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.4 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  39.64 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>