More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1646 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 133 aa  260  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  47.33 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  49.19 
 
 		 146 aa  116  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  46.51 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  46.51 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  48.84 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  47.29 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5570  MerR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  50.5 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3212  MerR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356219  normal  0.122177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  46.61 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 150 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 133 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  41.09 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  44.66 
 
 		 137 aa  88.6  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  41.9 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  40.98 
 
 		 162 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  41.9 
 
 		 148 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  39.42 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  39.42 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  40.95 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  39.64 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  43.52 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  42.72 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  42.74 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  37.21 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  38.33 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  39.64 
 
 		 135 aa  84.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2198  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  38.52 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  43.52 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  38.76 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  41.28 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  31.5 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  40.31 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  37.21 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  40.31 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  41.75 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  33.6 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2421  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.44 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.732276  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  41.23 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  34.35 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>