More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1934 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1934  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  298  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.210113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 153 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00354  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  56.39 
 
 		 136 aa  159  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.784451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  54.96 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  51.09 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00394  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  49.63 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2090  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 144 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 136 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2675  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 150 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1416  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 175 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.185788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  33.8 
 
 		 157 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  33.1 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  33.9 
 
 		 171 aa  86.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  33.09 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  30.22 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  32.39 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  32.39 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  32.39 
 
 		 173 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  32.37 
 
 		 171 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  30.92 
 
 		 176 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  32.64 
 
 		 171 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  30.92 
 
 		 176 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  36.13 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  34.13 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  33.05 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  31.54 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  31.54 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  28.47 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  28.47 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  33.05 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  33.9 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  28.87 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  31.34 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  33.07 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  33.06 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  31.06 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  25.19 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  31.58 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  33.61 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  29.32 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  29.32 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  32.04 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  25.74 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  29.32 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  29.55 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  34.85 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  33.59 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.89 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  28.95 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.78 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  28.99 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  28.15 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  26.23 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  30.83 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  27.83 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  30.66 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  28.79 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  32.2 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>