More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3005 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  291  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  62.31 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1934  MerR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.210113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  40.91 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1416  MerR family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 175 aa  123  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.185788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2675  MerR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00354  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  40.15 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.784451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2090  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00394  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  41.67 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  30.71 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  36.72 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  39.69 
 
 		 135 aa  93.6  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  37.59 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  45.54 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  28.37 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  28.37 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  35.21 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  35.21 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  35.21 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  35.21 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  35.21 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  35.21 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  35.21 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  35.21 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  34.51 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  34.51 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  44.07 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  37.88 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  34.51 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  34.51 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  34.51 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  31.21 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  41.13 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  41.58 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  35.82 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  31.21 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  44.55 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  31.62 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  35.82 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  35.82 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  40 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  31.88 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  35.82 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  44.55 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  31.58 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  31.58 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  38.62 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  39.6 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  31.06 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  32.58 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  30.43 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  32.33 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  32.33 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  36.17 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  35.61 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  32.58 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  32.58 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  36.17 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  38.39 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  38.39 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  34.9 
 
 		 148 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  31.11 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3479  MerR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  36.55 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  37.59 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 		 157 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  31.85 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  38.61 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  32.58 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  32.12 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  30.08 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  32.82 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  39.1 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  33.57 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  33.85 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>