More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13367 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  299  8.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  51.94 
 
 		 129 aa  133  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  51.16 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  51.16 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  48.84 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3212  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 129 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356219  normal  0.122177 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  49.5 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  40.15 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  39.23 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  40.46 
 
 		 156 aa  97.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  40.46 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  40.46 
 
 		 163 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  39.67 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 171 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 176 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 171 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  38.81 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  34.01 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 146 aa  94.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  37.67 
 
 		 153 aa  94  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 133 aa  93.6  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  39.55 
 
 		 173 aa  93.6  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  40.71 
 
 		 146 aa  93.2  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  37.12 
 
 		 177 aa  92.8  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  38.06 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  37.78 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 		 135 aa  90.1  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 146 aa  89.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  44.76 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  35.29 
 
 		 170 aa  88.2  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 172 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 		 171 aa  87.8  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  34.81 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  40 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  39.23 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  42.59 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  36.69 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  33.09 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 128 aa  84.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.97 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.82 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  39.57 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  35.88 
 
 		 186 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  37.7 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  35.88 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 155 aa  84  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.11 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>