More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2916 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2916  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  308  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2593  MerR family transcriptional regulator  64.9 
 
 
152 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0365897  normal  0.180328 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1215  transcriptional regulator, MerR family  64.24 
 
 
152 aa  186  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.460716  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3479  MerR family transcriptional regulator  62.42 
 
 
156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1816  MerR family transcriptional regulator  65.65 
 
 
154 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0245036  normal  0.855302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4002  MerR family transcriptional regulator  64.57 
 
 
152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  45.99 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  45.99 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 
157 aa  117  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  45.99 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  45.99 
 
 
156 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  44.44 
 
 
148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  43.65 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 
186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
147 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
143 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
143 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.89 
 
 
143 aa  110  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.04 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
143 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
143 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.89 
 
 
143 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 
132 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 
147 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
143 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  41.89 
 
 
143 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.89 
 
 
143 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
143 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
150 aa  107  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
143 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  43.85 
 
 
134 aa  107  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
144 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
149 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
132 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
132 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
146 aa  104  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  42.86 
 
 
146 aa  104  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  41.91 
 
 
152 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
154 aa  103  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
154 aa  103  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
146 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
143 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  39.69 
 
 
132 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  41.27 
 
 
145 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
133 aa  100  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  40.31 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  39.29 
 
 
170 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  42.52 
 
 
143 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
144 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  43.7 
 
 
175 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
134 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  42.48 
 
 
135 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.43 
 
 
138 aa  98.2  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
135 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
162 aa  97.1  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  38.17 
 
 
160 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  38.17 
 
 
160 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  38.35 
 
 
141 aa  94.4  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
135 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 
144 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  39.82 
 
 
133 aa  91.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
135 aa  91.3  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
135 aa  91.3  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
135 aa  91.3  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
135 aa  91.3  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
135 aa  91.3  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
135 aa  91.3  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
135 aa  91.3  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  35.37 
 
 
141 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  35.37 
 
 
141 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  35.37 
 
 
141 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  38.81 
 
 
158 aa  90.1  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  34.69 
 
 
141 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  34.69 
 
 
141 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
174 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  40.87 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  38.81 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.261357 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  35.37 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  35.37 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  38.06 
 
 
159 aa  87.8  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  35.37 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>