More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5683 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  304  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  304  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  83.22 
 
 		 149 aa  257  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 162 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 159 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  61.19 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 159 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 149 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  52.27 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0208  MerR family regulatory protein  51.91 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7803  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  51.91 
 
 		 152 aa  139  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  52.67 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  52.67 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 164 aa  133  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7475  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 162 aa  133  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 155 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 145 aa  127  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 137 aa  124  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  40.46 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5680  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 171 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6044  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 171 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  36.45 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  36.45 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  45.63 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  43.12 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  37.84 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  38.32 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.73 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  39.6 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.24 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.24 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  38.6 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  38.1 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  45 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.57 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4002  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3242  transcriptional regulator, MerR family  41.44 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2198  transcriptional regulator, MerR family  35.78 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  36.61 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  33.96 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  36.04 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  39.09 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  37.38 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  38.68 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.96 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0693  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  36.79 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  38.32 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  38.32 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  38.32 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>