More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_29010 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  324  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  90.91 
 
 		 143 aa  259  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  62.84 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 159 aa  180  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  58.39 
 
 		 149 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 149 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  58.02 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0208  MerR family regulatory protein  52 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  54.07 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 156 aa  141  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  49.62 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 145 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7475  MerR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5680  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 171 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6044  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 171 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  44.34 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  38.21 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  38.21 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  34.26 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  36.13 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  40.43 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  37.61 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  37.5 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  36.17 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2733  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  37.5 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  39.6 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  37.5 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  37.5 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  37.5 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0466  MerR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14720  predicted transcriptional regulator  33.86 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  0.772199 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  35.78 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  36.63 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  33.85 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  38.89 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  38.89 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  38.89 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  38.89 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  36.04 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>