More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3397 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  237  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  45 
 
 		 152 aa  86.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7475  MerR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 145 aa  84.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 164 aa  84  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.94 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.94 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  46.43 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  44.83 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5680  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6044  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  38.14 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  36.89 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  39.45 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  36.89 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  36.89 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  36.89 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  36.89 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  38.94 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 159 aa  76.6  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  36.07 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
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NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  37.61 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  38.68 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
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NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  37.38 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  37.38 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0208  MerR family regulatory protein  53.73 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7803  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  37.17 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  37.17 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  37.17 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  37.17 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  37.17 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  37.17 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  37.17 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  37.17 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  37.17 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  38.26 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  34.91 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 162 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  38.21 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  47.06 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  38.18 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
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NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  36.28 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  45.59 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  39 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
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NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 132 aa  67  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
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NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 132 aa  67  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  37.63 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.86 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
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NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.86 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.86 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.86 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
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NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.86 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
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NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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