More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0208 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009504  BOV_A0208  MerR family regulatory protein  100 
 
 
154 aa  308  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7803  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  99.35 
 
 
154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  68.57 
 
 
147 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  58.87 
 
 
164 aa  176  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7475  MerR family transcriptional regulator  65.65 
 
 
162 aa  174  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831533  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  60.43 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  58.78 
 
 
145 aa  170  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  54.3 
 
 
157 aa  168  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  58.78 
 
 
145 aa  167  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  58.02 
 
 
145 aa  166  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  58.02 
 
 
145 aa  167  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5680  MerR family transcriptional regulator  60.45 
 
 
171 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6044  MerR family transcriptional regulator  60.45 
 
 
171 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  56.72 
 
 
159 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  56.49 
 
 
149 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  55.97 
 
 
159 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  53.24 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  50.33 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  52 
 
 
162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  55.22 
 
 
143 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  51.91 
 
 
149 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  51.91 
 
 
149 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  56.03 
 
 
156 aa  140  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  51.77 
 
 
152 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  56.74 
 
 
152 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  56.74 
 
 
152 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  54.96 
 
 
137 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  54.96 
 
 
155 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  49.65 
 
 
152 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  50.77 
 
 
138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  53.73 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  42.54 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  44.87 
 
 
132 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  41.41 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.41 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.66 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  34.58 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  36.59 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  38.21 
 
 
234 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  39.81 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  39.58 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  39.58 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.27 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.27 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.27 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  39.5 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  41.86 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  38.66 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2916  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  43.01 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  34.62 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  38.83 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  39.78 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.78 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
182 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  36.08 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  30.07 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0157  MerR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  37.5 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  35.45 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>