More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6044 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5680  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  342  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6044  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  342  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7475  MerR family transcriptional regulator  72.5 
 
 		 162 aa  218  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  70.99 
 
 		 147 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  55.35 
 
 		 157 aa  168  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  56.69 
 
 		 154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0208  MerR family regulatory protein  56.05 
 
 		 154 aa  160  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7803  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  52.53 
 
 		 159 aa  155  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  54.96 
 
 		 145 aa  153  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 145 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 145 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 159 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  49.01 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 156 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 143 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 152 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  51.91 
 
 		 155 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  49.62 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  47.48 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 138 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  37.38 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  37.38 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  37.61 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  37.61 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  35.87 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  37.04 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4002  MerR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  37.62 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14720  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 148 aa  62  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  0.772199 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  41.3 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  41.3 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 133 aa  62  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  40.22 
 
 		 129 aa  62  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5384  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  44 
 
 		 132 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  44.78 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  44.78 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  44.78 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  44.78 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  44.78 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  34.23 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  44 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  31.75 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  37.11 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4673  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156077  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2081  MerR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  47.76 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  34.04 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  44.78 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  44.78 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  44.78 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  44.78 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  44.78 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2916  MerR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  47.76 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  44.78 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  44.78 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>