More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3828 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
122 aa  239  9e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  48.36 
 
 
133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  49.18 
 
 
123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  48.36 
 
 
123 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  45.69 
 
 
129 aa  98.6  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  42.45 
 
 
135 aa  83.6  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  40.74 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  40.74 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  40.57 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  32.77 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  41.84 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  37.96 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  43.69 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  31.93 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.62 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  40.78 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  37.62 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  41.05 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  40.82 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  43.81 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  38.68 
 
 
156 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  38.79 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  43.81 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
175 aa  70.5  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  35.51 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  35.51 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  35.51 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  38.68 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.29 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  33.61 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  35.88 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  35.64 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6119  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.0458667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  36.19 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  41.35 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
136 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 
133 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  35.83 
 
 
135 aa  67  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
135 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  39.25 
 
 
186 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2322  transcription regulator protein  36 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  38.53 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  36.79 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  37.38 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  47.76 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.790418 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  36.63 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  36.63 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  36.63 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  35.83 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  36.63 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2675  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  37.76 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  37.76 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  36.63 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  36.63 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  36.63 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  36.63 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>