More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2417 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 304 aa  596  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  70.32 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20960  predicted transcriptional regulator  70.1 
 
 		 310 aa  359  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.376744  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  54 
 
 		 278 aa  279  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  37.75 
 
 		 249 aa  85.9  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  34.75 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  31.88 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  44.94 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  38.6 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  56.92 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  32.28 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  43.68 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  37.78 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  49.32 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 272 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  40 
 
 		 129 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  50.79 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  33.13 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  50.77 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  37.5 
 
 		 147 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  35.05 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  48.53 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  30.7 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  34.53 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  29.32 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 145 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  45.61 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  40.35 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  38.05 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  37.36 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 140 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 		 128 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 140 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 154 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  42.31 
 
 		 129 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  33.53 
 
 		 246 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  38.83 
 
 		 128 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36.21 
 
 		 162 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  35.58 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  35.85 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  32.43 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  35.4 
 
 		 136 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 138 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  35.51 
 
 		 141 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  40.51 
 
 		 146 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 139 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  32.99 
 
 		 151 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 128 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 125 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 136 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 138 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 125 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 264 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 129 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 143 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 161 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 125 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  40.32 
 
 		 130 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  30.07 
 
 		 135 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  42.65 
 
 		 141 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 639 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 630 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 659 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  53.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 630 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  41.03 
 
 		 129 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2198  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 134 aa  53.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 139 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 162 aa  53.1  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 134 aa  53.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 159 aa  53.1  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 127 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>