More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4282 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 308 aa  597  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  70.55 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20960  predicted transcriptional regulator  67.75 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.376744  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  57.33 
 
 		 278 aa  287  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  37.39 
 
 		 260 aa  85.9  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  38.4 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  31.88 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  35.5 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  38.83 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  40.82 
 
 		 242 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  49.23 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  49.21 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  45.78 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  28.18 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  36.22 
 
 		 249 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  34.71 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  41.46 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  49.12 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  33.33 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  40.35 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  43.86 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 132 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  38.46 
 
 		 147 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  46.88 
 
 		 129 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 125 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 140 aa  55.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 125 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 140 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 125 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 145 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 139 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 149 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  39.06 
 
 		 129 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 126 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 136 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  31.13 
 
 		 178 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 648 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 161 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 128 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 151 aa  53.9  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  42.65 
 
 		 154 aa  53.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 143 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 140 aa  53.1  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 264 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 141 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  47.62 
 
 		 290 aa  53.1  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 145 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  36.36 
 
 		 141 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  35.29 
 
 		 142 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  36.75 
 
 		 246 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 128 aa  52.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 128 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  36.9 
 
 		 133 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  28.14 
 
 		 144 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 133 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 139 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 149 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 141 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 141 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 132 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.35 
 
 		 132 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 132 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  30.83 
 
 		 135 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 157 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 639 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 		 138 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 158 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 141 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 146 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  28.14 
 
 		 144 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  39.39 
 
 		 136 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 136 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 162 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.11 
 
 		 162 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>