More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1160 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 133 aa  268  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  75.61 
 
 		 125 aa  184  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  75.61 
 
 		 125 aa  184  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  75.61 
 
 		 125 aa  184  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  55.37 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  56.92 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  51.56 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  51.33 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 186 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  52.63 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  47.97 
 
 		 133 aa  110  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  47.54 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  47.01 
 
 		 134 aa  103  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  71.43 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  70.77 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  66.15 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2779  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 180 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4918  MerR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502538 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  49.25 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  48.53 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 252 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  46.97 
 
 		 252 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  44.3 
 
 		 258 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  46.97 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  43.24 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1555  MerR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  39.71 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 257 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 639 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  45.07 
 
 		 259 aa  67.4  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  32.54 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 343 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 342 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.78 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  45.9 
 
 		 342 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  39.44 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 342 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  40.79 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 342 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  34 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 630 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  45.07 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 630 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  43.42 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 659 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 648 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  45.59 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.85 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  44.78 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  43.42 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0495  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  45.59 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  44.12 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  45.59 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  45.59 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>