More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09690 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  545  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  43.95 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  37.81 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  40.74 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  49.15 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  43.67 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  36.9 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 254 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  48.15 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 272 aa  94  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  36.32 
 
 		 258 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  38.19 
 
 		 246 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  55.42 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  45.3 
 
 		 241 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  52.75 
 
 		 252 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  45.63 
 
 		 246 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  35.89 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  33.66 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  46.74 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  44.76 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  43 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  54.41 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  40.43 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  31.64 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  31.79 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  48.57 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 149 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 138 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  31.35 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 141 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 137 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  33.86 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  32.27 
 
 		 354 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 253 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  47.62 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  35.58 
 
 		 133 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  40.95 
 
 		 135 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  40.59 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 149 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  45.71 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.27 
 
 		 162 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.7 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  38.74 
 
 		 129 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  47.76 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 137 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  38.84 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5066  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  36.94 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1950  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.329857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  33.1 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  38.74 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  38.1 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  34.31 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  33.62 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  35.58 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  38.53 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  32.11 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 630 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 659 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 132 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  34.74 
 
 		 147 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 136 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 630 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 161 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>