More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1820 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
270 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  72.86 
 
 
269 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  73.23 
 
 
269 aa  428  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  72.49 
 
 
269 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  72.49 
 
 
269 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  72.49 
 
 
269 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  72.12 
 
 
269 aa  418  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  72.12 
 
 
269 aa  418  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  72.12 
 
 
269 aa  417  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2581  transcriptional regulator, putative  68.4 
 
 
212 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0799223  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  50.92 
 
 
273 aa  276  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  33.09 
 
 
274 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  34.19 
 
 
271 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  35.19 
 
 
269 aa  149  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
287 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 
272 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  28.16 
 
 
269 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.85 
 
 
280 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  31.14 
 
 
270 aa  123  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  33.53 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  30.39 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  26.97 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
289 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  27.27 
 
 
276 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  26.88 
 
 
271 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  23.44 
 
 
274 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  26.6 
 
 
286 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  28.83 
 
 
281 aa  105  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  25.81 
 
 
274 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  25.81 
 
 
274 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  26.62 
 
 
273 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
273 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  25.93 
 
 
264 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  24.57 
 
 
293 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
281 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  28.17 
 
 
286 aa  99.4  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  25.18 
 
 
273 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  25.52 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  27.65 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  24.63 
 
 
262 aa  92.4  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
280 aa  92  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  24.26 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  27 
 
 
279 aa  89  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  24.54 
 
 
258 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
287 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  22.3 
 
 
276 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
132 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  24.26 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  22.38 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  23.79 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  22.81 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  22.51 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  24.9 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  21.51 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  24.91 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  22.54 
 
 
276 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  22.54 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  22.18 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  21.83 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  22.89 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  21.83 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  22.22 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  20.79 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  22.18 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  29.2 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  20.94 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  21.83 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2580  MerR family transcriptional regulator  82.05 
 
 
39 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0100504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1848  MerR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  34.21 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  34.55 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 
252 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  31.08 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
277 aa  62.4  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  37.61 
 
 
347 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  30.1 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
188 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  27.01 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  20.82 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
258 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0098  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
279 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000252188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  36.23 
 
 
361 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  31.51 
 
 
284 aa  59.7  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 
354 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  34.65 
 
 
256 aa  59.7  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  33.65 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>