More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1265 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 252 aa  501  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  51.49 
 
 		 241 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  48.33 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  47.01 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  44.73 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  40.77 
 
 		 247 aa  161  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  41.7 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  44.74 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  44.92 
 
 		 272 aa  92  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  32.3 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  33.12 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  40.65 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  39.32 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  44.3 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  38.82 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  45.45 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  41.3 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  31.47 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  45.61 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  38.6 
 
 		 265 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  52.75 
 
 		 290 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  45.61 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  43.24 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  39.25 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  37.38 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  40.21 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  36.63 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  44.26 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  29.81 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  28.12 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 175 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  34.83 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 154 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  37.78 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  34.41 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  24.88 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  36.79 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 142 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 167 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 136 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  46 
 
 		 126 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 173 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  22.89 
 
 		 135 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  36.54 
 
 		 132 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 		 141 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  34.69 
 
 		 133 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  34 
 
 		 154 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  24.38 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  32.35 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  32.35 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 142 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 188 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 138 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 149 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 142 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  44.83 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  30.89 
 
 		 130 aa  53.1  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  31.67 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 145 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 139 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 145 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  32.74 
 
 		 245 aa  52.8  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  33.03 
 
 		 142 aa  52.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 137 aa  52.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  26.67 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>