More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0420 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 255 aa  504  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  35.86 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  35.37 
 
 		 163 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  40.98 
 
 		 157 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  40.98 
 
 		 157 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  40.16 
 
 		 157 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  40.16 
 
 		 156 aa  87  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2090  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 143 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  40.16 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  40.16 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  40.16 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  40.16 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 129 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  37.7 
 
 		 159 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 156 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.94 
 
 		 135 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  32.26 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  36.84 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  39.81 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  38.52 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14720  predicted transcriptional regulator  37.01 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  0.772199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2421  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36.08 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.732276  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  37.7 
 
 		 171 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2051  transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  37.7 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  36.89 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  36.07 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  40.37 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  34.23 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 154 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 129 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  34.92 
 
 		 138 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 148 aa  74.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 126 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  36.75 
 
 		 134 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 142 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1385  transcriptional regulator of MerR family protein  33.59 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  37.27 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.96 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 144 aa  72  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 146 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  45.07 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  34.51 
 
 		 135 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  29.6 
 
 		 130 aa  70.5  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  32.03 
 
 		 144 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 152 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 132 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0023  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  36.04 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 135 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  37.58 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.55 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.55 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.55 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  37.58 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  28.8 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1215  transcriptional regulator, MerR family  34.21 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.460716  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  33.96 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2593  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0365897  normal  0.180328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  27.42 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  34.26 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 140 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 128 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1934  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 142 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.210113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  37.07 
 
 		 140 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 149 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00354  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  28.57 
 
 		 136 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.784451  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 140 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 145 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  36.28 
 
 		 137 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>