More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0543 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 252 aa  490  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  57.94 
 
 		 254 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  55.34 
 
 		 256 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  57.87 
 
 		 265 aa  251  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  57.42 
 
 		 264 aa  248  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  48.18 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  42.02 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  48.25 
 
 		 126 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  38.73 
 
 		 290 aa  92.8  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 		 272 aa  89.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  49.5 
 
 		 246 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  43.81 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  40.77 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  43.3 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  41.58 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  33.53 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  35.06 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  39.32 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  36.84 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  56.67 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  41.11 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  40.4 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  50.72 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  45.1 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  40.38 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  41.94 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  39.02 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  34.21 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  44.12 
 
 		 130 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  42.39 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  26.67 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 142 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.67 
 
 		 132 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  27.23 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 142 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  38.04 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  30.05 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  42 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  27.11 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  31.16 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 146 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  36.56 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 128 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  35.19 
 
 		 144 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  44.59 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  39 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  26.22 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  31.79 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20960  predicted transcriptional regulator  53.33 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.376744  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  44.12 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  39 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  36.36 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  37.78 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  37.86 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 127 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  33.65 
 
 		 147 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 127 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 173 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 128 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 141 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1385  transcriptional regulator of MerR family protein  33.63 
 
 		 153 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>