More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0824 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  567  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  63.7 
 
 		 302 aa  358  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  63.12 
 
 		 303 aa  349  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  60.27 
 
 		 295 aa  312  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  48.55 
 
 		 319 aa  262  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  50.65 
 
 		 320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  51.95 
 
 		 319 aa  242  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  44.63 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  48.01 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2162  transcriptional regulator, MerR family  34.93 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0710491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1311  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.0692282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1354  regulatory protein, MerR  36.45 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  33.73 
 
 		 339 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 138 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  36.42 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 132 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4945  regulatory protein, MerR  49.23 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0828053  hitchhiker  0.00815362 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  46.43 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  34.55 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  52.24 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  27.62 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 140 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  27.62 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 155 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 343 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 141 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  27.87 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  40.74 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  27.48 
 
 		 253 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  47.76 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  43.52 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  35.56 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  44.76 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  35.35 
 
 		 170 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  28.45 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 136 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 186 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  44.12 
 
 		 145 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5373  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 145 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  38.68 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 175 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  31.03 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 140 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 150 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  35.19 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  27.35 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  46.27 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  46.27 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  29.37 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 136 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 161 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>