More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5373 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5373  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 145 aa  293  7e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4945  regulatory protein, MerR  53.85 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0828053  hitchhiker  0.00815362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2648  regulatory protein MerR  49.3 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  37.04 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  45.59 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  26.21 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  26.21 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  34.27 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  36.13 
 
 		 354 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 300 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  35.19 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  35.19 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  35.35 
 
 		 326 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  34.95 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  41.56 
 
 		 336 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  36.7 
 
 		 252 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  40.26 
 
 		 339 aa  63.5  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  37.27 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 303 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 342 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 342 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 342 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 343 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 342 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 319 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 342 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.31 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  34.55 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.77 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  30.39 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  36.04 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  32.46 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  31.5 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  33.85 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.24 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 333 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  31.9 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  31.13 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  29.91 
 
 		 342 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  33.66 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  34.17 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1805  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.665763 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  33.01 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  35.42 
 
 		 234 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 		 345 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 257 aa  57  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  27.07 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  27.07 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  27.07 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 302 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  27.07 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>