More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2648 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2648  regulatory protein MerR  100 
 
 		 183 aa  361  3e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5373  transcriptional regulator, MerR family  49.3 
 
 		 145 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4945  regulatory protein, MerR  46.97 
 
 		 147 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0828053  hitchhiker  0.00815362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  35.19 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  47.06 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  31.36 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  30.37 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  42.72 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.94 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  30.83 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  29.69 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3555  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0311437  normal  0.0197262 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  34.62 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  31.93 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 149 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  38 
 
 		 122 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 129 aa  53.9  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 333 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 153 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2558  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 128 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.327244 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 132 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  30.89 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  31.3 
 
 		 132 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1950  MerR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.329857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  31.36 
 
 		 354 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1805  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.665763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  30.4 
 
 		 299 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0450  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 		 116 aa  53.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.58699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 122 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 138 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 339 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  29.32 
 
 		 256 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  34.4 
 
 		 132 aa  52.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 135 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 135 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 135 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 255 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 135 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  28.23 
 
 		 135 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  38.94 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  37.63 
 
 		 302 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  30.61 
 
 		 138 aa  52.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 135 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  32.11 
 
 		 326 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1332  transcriptional regulator, MerR family  32.17 
 
 		 128 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0224558 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  28.23 
 
 		 135 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2652  transcriptional regulator, MerR family  31.09 
 
 		 123 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 142 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 129 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 134 aa  52  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 128 aa  52  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 131 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  31.78 
 
 		 252 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 238 aa  51.6  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  26.21 
 
 		 244 aa  51.6  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 303 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>