More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3223 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
134 aa  274  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1332  transcriptional regulator, MerR family  61.72 
 
 
128 aa  169  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0224558 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2558  transcriptional regulator, MerR family  61.79 
 
 
128 aa  167  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.327244 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  57.03 
 
 
129 aa  156  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  60.34 
 
 
127 aa  148  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1187  transcriptional regulator, MerR family  55.36 
 
 
129 aa  140  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  53.21 
 
 
118 aa  120  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0450  transcriptional regulator, MerR family  46.9 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.58699  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 
131 aa  97.1  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  37.01 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  40.35 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 
143 aa  94  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3555  MerR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0311437  normal  0.0197262 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1799  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 
127 aa  92  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  37.27 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  40.68 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  37.17 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  33.87 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  40.18 
 
 
118 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
144 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1089  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
128 aa  87  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0158678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  35.45 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1810  transcriptional regulator, MerR family  39.09 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  normal  0.140149 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1570  transcriptional regulator  34.55 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7602  putative transcriptional regulator, MerR family  38.39 
 
 
120 aa  84.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621201  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 
118 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
153 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0487  transcriptional regulator, MerR family  36.61 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.452136  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0082  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4570  regulatory protein MerR  39.82 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1484  MerR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
255 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
201 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  37.27 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  35.78 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4050  MerR family transcriptional regulator  41.59 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  35.43 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3138  MerR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267666  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  36.7 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1435  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0777608  normal  0.768186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  34.48 
 
 
491 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2072  transcriptional regulator  41.77 
 
 
79 aa  77  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5353  transcriptional regulator, MerR family  34.21 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657769  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  33.62 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  35.65 
 
 
449 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2652  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1817  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1615  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  30.63 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3872  transcriptional regulator, MerR family protein  39.6 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1968  transcriptional regulator, MerR family  30.7 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl171  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3563  transcriptional regulator, MerR family  29.73 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0435  putative transcriptional regulator, MerR family  32.79 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517587  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00910  predicted transcriptional regulator  29.86 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.975213  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2511  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.22268  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2240  transcriptional regulator  36.84 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1547  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2478  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.263723 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1606  transcriptional regulator, MerR family  32.69 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011829  hitchhiker  0.00000000000215836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2084  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0836  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3633  transcriptional regulator, MerR family  30.63 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1781  transcriptional regulator, MerR family  26.72 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  33.08 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  34.86 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1362  transcriptional regulator  30.7 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.270977  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl251  MerR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000105491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  31.11 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  33 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>