More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4910 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 334 aa  653    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 345 aa  361  9e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  57.99 
 
 		 354 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  55.49 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  55.62 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  55.02 
 
 		 333 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  50 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  51.48 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  47.19 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  32.93 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  43.18 
 
 		 252 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  46.51 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  48.68 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  48.53 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5373  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  46.48 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  45.59 
 
 		 134 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  42.22 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 154 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  50.75 
 
 		 138 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 258 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 136 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 132 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 167 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 167 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 143 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  41.12 
 
 		 117 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 639 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  48.44 
 
 		 147 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  34.78 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 630 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 630 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 136 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 136 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 136 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 659 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  37.93 
 
 		 129 aa  67  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  37.76 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  37.39 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  36.36 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  37.78 
 
 		 244 aa  65.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  49.21 
 
 		 142 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 143 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  48.39 
 
 		 154 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  33.85 
 
 		 159 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  28.34 
 
 		 252 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0032  MerR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 134 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 144 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  39.13 
 
 		 136 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 137 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.27 
 
 		 134 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 129 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 134 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 63 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  43.28 
 
 		 132 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.28 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  25.55 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  31.96 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 136 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  43.33 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  46.77 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.77 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>