More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8151 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 302 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  63.25 
 
 		 303 aa  347  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  58.14 
 
 		 295 aa  333  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  62.71 
 
 		 300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  44.37 
 
 		 319 aa  251  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  50.97 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  48.04 
 
 		 320 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  44.84 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  44.74 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2162  transcriptional regulator, MerR family  36.12 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0710491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1354  regulatory protein, MerR  37.18 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  39.52 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1311  MerR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.0692282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 131 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  43.75 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  47.69 
 
 		 148 aa  68.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 141 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  32.73 
 
 		 133 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 130 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  44.74 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  43.94 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 125 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 147 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 138 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 125 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  45.16 
 
 		 141 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 125 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 135 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  39.71 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  31.36 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  40.91 
 
 		 133 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  29.46 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  44.29 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  29.92 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  31.58 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  28.03 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  25.93 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  25.93 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  25.93 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  36.67 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  31.78 
 
 		 132 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  35.71 
 
 		 145 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 137 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 136 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 150 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.58 
 
 		 156 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  30.67 
 
 		 148 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  30.67 
 
 		 148 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  30.15 
 
 		 137 aa  61.6  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  35.06 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 136 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  26.2 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  27.4 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 136 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  30.3 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  33.01 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  28.85 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  29.63 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>