More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0450 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0450  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
116 aa  228  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.58699  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  62.73 
 
 
129 aa  142  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  46.9 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  40.71 
 
 
127 aa  102  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2558  transcriptional regulator, MerR family  44.95 
 
 
128 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.327244 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
129 aa  99.4  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1332  transcriptional regulator, MerR family  41.28 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0224558 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1187  transcriptional regulator, MerR family  34.86 
 
 
129 aa  95.1  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1089  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
128 aa  89  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0158678  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
153 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  33.63 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  35.45 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7602  putative transcriptional regulator, MerR family  33.62 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621201  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2072  transcriptional regulator  42.47 
 
 
79 aa  79  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  35.78 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  31.19 
 
 
128 aa  77  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3555  MerR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0311437  normal  0.0197262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  39.18 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  30.28 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
198 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1606  transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011829  hitchhiker  0.00000000000215836 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3872  transcriptional regulator, MerR family protein  37.07 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  32.43 
 
 
449 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
190 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  34.51 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4050  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  31.19 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1484  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4570  regulatory protein MerR  31.19 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  28.44 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  32.11 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0082  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.67 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  29.09 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2652  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  30.3 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  28.18 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4563  transcriptional regulator, MerR family  31.19 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1799  transcriptional regulator, MerR family  38.32 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1810  transcriptional regulator, MerR family  28.97 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  normal  0.140149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  28.3 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.18 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  32.41 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  30.36 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2511  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.22268  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  31.53 
 
 
491 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  30.17 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  29.52 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3138  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
117 aa  62.8  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267666  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3633  transcriptional regulator, MerR family  28.07 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
201 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
149 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
134 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2084  transcriptional regulator, MerR family  32.56 
 
 
191 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5353  transcriptional regulator, MerR family  30.09 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657769  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>