More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5143 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  96.02 
 
 
251 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  59.92 
 
 
254 aa  292  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  60.66 
 
 
259 aa  288  5.0000000000000004e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  50.61 
 
 
253 aa  241  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  46.72 
 
 
274 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  50.4 
 
 
251 aa  222  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  47.18 
 
 
253 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  47.62 
 
 
254 aa  205  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  44.94 
 
 
252 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  46.47 
 
 
278 aa  202  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  47.35 
 
 
271 aa  201  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  43.95 
 
 
258 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  44.49 
 
 
252 aa  198  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  44.76 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
257 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  45.8 
 
 
270 aa  186  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
268 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  41.35 
 
 
272 aa  175  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  29.05 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  33.61 
 
 
243 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  33.61 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  34.02 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  34.02 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  36.55 
 
 
259 aa  126  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  32.66 
 
 
244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  34.65 
 
 
244 aa  125  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  33.61 
 
 
243 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  33.61 
 
 
243 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  33.61 
 
 
243 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  32.66 
 
 
244 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  31.15 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
256 aa  118  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  30.49 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  31.73 
 
 
255 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  31.95 
 
 
250 aa  113  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  27.64 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  31.95 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
253 aa  109  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  30.92 
 
 
245 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
238 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  46.72 
 
 
429 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
258 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  45.97 
 
 
377 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
237 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  27.76 
 
 
253 aa  95.9  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  26.67 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  26.67 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  31.93 
 
 
242 aa  92  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  27.13 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  23.69 
 
 
250 aa  87  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  29.13 
 
 
252 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
288 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  33.48 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  33.58 
 
 
252 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 
342 aa  82  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  33.2 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  30.61 
 
 
284 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  30.45 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  36.11 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  35.19 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  28.57 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  38.66 
 
 
133 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  34.26 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  52.31 
 
 
125 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  52.31 
 
 
125 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  52.31 
 
 
125 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  24.38 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  41.59 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  24.38 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  37.63 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
128 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  54.41 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  45.36 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  32.69 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  37.63 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  40.32 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  43.68 
 
 
342 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>