More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4400 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 303 aa  575  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  44.41 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  45.64 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  44.41 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  41.12 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  48.65 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  49.74 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  41.35 
 
 		 339 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1354  regulatory protein, MerR  41.45 
 
 		 333 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2162  transcriptional regulator, MerR family  39.9 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0710491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1311  MerR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.0692282 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 136 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 129 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 186 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 151 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  33.59 
 
 		 151 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  38.35 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  35.45 
 
 		 144 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  30.47 
 
 		 132 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  34.23 
 
 		 143 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  34.23 
 
 		 143 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  40.4 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  36.04 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  33.33 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36.04 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 147 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 		 133 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  31.75 
 
 		 148 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 144 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  31.01 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 132 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 147 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  36.36 
 
 		 146 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 146 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 132 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  32.31 
 
 		 135 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 126 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 147 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 136 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  34.26 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0466  MerR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 134 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  34.31 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  34.86 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  43.28 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  39.81 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 135 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  41.35 
 
 		 135 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 135 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  33.74 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 160 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 160 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 122 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 148 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  27.69 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  44.93 
 
 		 135 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 148 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  44.26 
 
 		 137 aa  64.3  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 155 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  47.76 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  40.58 
 
 		 136 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 		 143 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  35.64 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  33.09 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  31.58 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  29.66 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>