More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5097 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 303 aa  604  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  64.12 
 
 		 295 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  63.25 
 
 		 302 aa  358  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  63.12 
 
 		 300 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  44.55 
 
 		 319 aa  255  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  48.08 
 
 		 319 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  43.56 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  45.66 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  43.77 
 
 		 303 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2162  transcriptional regulator, MerR family  31.55 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0710491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1311  MerR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.0692282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  34.02 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1354  regulatory protein, MerR  38.34 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  32.73 
 
 		 133 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  49.23 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  34.58 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 150 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  49.23 
 
 		 136 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 138 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4945  regulatory protein, MerR  45.07 
 
 		 147 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0828053  hitchhiker  0.00815362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 145 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  30.47 
 
 		 132 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  42.39 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 136 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  38.24 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  40.21 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  36.04 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  41.25 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  34.35 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 145 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  31.94 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 134 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 136 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  36.73 
 
 		 135 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  30.22 
 
 		 139 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 147 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 134 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  38.24 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 136 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  46.97 
 
 		 135 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 135 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 136 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  29.01 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  48.48 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 132 aa  64.3  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  44.62 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  42.67 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  34.55 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  41.54 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  34 
 
 		 139 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 155 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  41.54 
 
 		 129 aa  61.6  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 134 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 149 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.31 
 
 		 132 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5373  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 145 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  35.04 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  33.67 
 
 		 160 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  40.48 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  31.19 
 
 		 138 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 146 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>