More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0080 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 137 aa  277  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  62.5 
 
 		 135 aa  146  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  61.34 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  60.68 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  55.37 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  59.52 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  57.63 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 144 aa  121  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  57.48 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 125 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 125 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 125 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  51.54 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  49.58 
 
 		 134 aa  105  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  41.98 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  49.12 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2779  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  59.7 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4918  MerR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  52.24 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  52.24 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1555  MerR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  52.24 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 252 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 		 252 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 342 aa  71.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 343 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  37.11 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  48.48 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  43.37 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  50.75 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  39.64 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  39.45 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  39.64 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  38.03 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  37.97 
 
 		 252 aa  67.8  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  41.89 
 
 		 258 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  46.27 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  36.15 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.04 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  36.54 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  40.3 
 
 		 398 aa  67  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  36.27 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7475  MerR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  43.59 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.59 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  34.94 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>