More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4917 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  76.22 
 
 		 144 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  65.48 
 
 		 165 aa  197  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 147 aa  194  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2779  MerR family transcriptional regulator  60.58 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4918  MerR family transcriptional regulator  64.62 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502538 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  54.39 
 
 		 137 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  52.99 
 
 		 136 aa  122  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 133 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  51.2 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  51.3 
 
 		 135 aa  111  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  49.18 
 
 		 131 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  49.14 
 
 		 134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  49.58 
 
 		 133 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 125 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 125 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 125 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  43.41 
 
 		 156 aa  104  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  52.38 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  51.67 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  47.01 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  39.42 
 
 		 139 aa  85.5  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 136 aa  80.5  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1555  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  37.69 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  39.32 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  36.03 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  45.28 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  43.37 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.03 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  37.72 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  38.61 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  38.94 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  47.83 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  47.83 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.48 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  36.54 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.97 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  43.68 
 
 		 150 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  43.66 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  43.66 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  34.31 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1354  regulatory protein, MerR  47.37 
 
 		 333 aa  71.2  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 136 aa  70.5  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.84 
 
 		 134 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 134 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  44.78 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  45.83 
 
 		 144 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.27 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  35.25 
 
 		 132 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  42.11 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0951  transcriptional regulator, MerR family  31.91 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0159877  hitchhiker  0.00000555136 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  43.42 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.35 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  33.81 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  39.81 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.93 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  41.76 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  37 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  41.76 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  44.59 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  35.07 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  41.76 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  46.38 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  31.91 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>