More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1614 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 295 aa  575  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  64.12 
 
 		 303 aa  348  7e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  58.14 
 
 		 302 aa  326  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  59.53 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  41.61 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  42.38 
 
 		 299 aa  221  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  47.73 
 
 		 319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  44.63 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  44.56 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  41.2 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2162  transcriptional regulator, MerR family  34.23 
 
 		 338 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0710491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1311  MerR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.0692282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1354  regulatory protein, MerR  38.55 
 
 		 333 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 131 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 130 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  32.39 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  38.94 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  37 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 146 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  33.03 
 
 		 132 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  32.73 
 
 		 133 aa  65.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  25.81 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 163 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  26.51 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 144 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  36.73 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  31.62 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  43.06 
 
 		 136 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 141 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  34.58 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  43.08 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  42.5 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  29.57 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  40.7 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  30.7 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  30.7 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  26.51 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  35.92 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  36.17 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  38.27 
 
 		 137 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  37.86 
 
 		 129 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  36.9 
 
 		 139 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 140 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 137 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 135 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  33.78 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  32.46 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 139 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  26.73 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 149 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 137 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  33.78 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 		 132 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  32.2 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  29.51 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  30.83 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  22.65 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>